中大团队借助人工智能技术发现大量全新RNA病毒
10月9日,中大智中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》(Cell)杂志发表论文,团队报告了全球范围的借助技术AG超玩会入口180个超群、16万余种的人工RNA病毒发现,大幅扩展全球RNA病毒的发现多样性。该研究将人工智能技术应用于病毒鉴定,大量毒发现了传统研究方法未能发现的全新病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的中大智新路径。
论文发表在《细胞》(Cell)杂志上。借助技术
传统的人工病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,发现面对RNA病毒这种高度分化、大量毒AG超玩会入口种类繁多且容易变异的全新病毒识别效率低。在该研究中,中大智团队开发的LucaProt人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序列深度学习,并在数据集中自主判断病毒序列。利用这套算法,研究团队在来自全球生物环境样本的10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。
使用人工智能对全球病毒圈深度挖掘并分类。
“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒,这种能力在疾病防控和新病原的快速识别中尤为重要。特别是在疫情暴发时,人工智能的速度和精度可以帮助科学家更快地锁定潜在病原体。”施莽说。
通过进一步分析,团队报告了迄今最长的RNA病毒基因组,长度达到47250个核苷酸;发现了超出以往认知的基因组结构,展现出RNA病毒基因组进化的灵活性;识别到多种病毒功能蛋白,特别是与细菌相关的功能蛋白,进一步表明还有更多类型的RNA噬菌体亟待探索;发现在南极底泥、深海热泉、活性污泥和盐碱滩等极端环境中,RNA病毒的数量和多样性仍然较高。新病毒的发现,刷新着科学家对病毒圈的认识。
文章第一作者侯新(左三)和阿里云团队在中山大学医学院合影。
“面对远源的新病毒,现有的病毒分类体系已经显得力不从心。未来,这一体系在门、纲等更深层次的分类上,可能会有大规模的调整。”施莽说,“我们的研究展示了病毒多样性的深度,但广度仍有待更多样本的补充。病毒的多样性远超人类想象,我们目前所看到的仍是冰山一角。”
施莽表示,这项研究与阿里云飞天实验室的AI4S-生物计算团队合作开展,希望未来继续通过跨领域科研合作,充分利用云计算和人工智能的优势,解决生命科学领域的重要问题。
南方网、粤学习记者 刘单燕
通讯员 朱嘉豪 李建平
- ·一码溯源!药品追溯码如何让每盒药“来源可查,去向可追”
- ·11月12日,梅州市梅县区“1108”疫情新增感染者10例
- ·解码2022年梅州“客家炒绿茶王”的成功之路:匠心制好茶,创新赢市场
- ·台风外围环流+冷空气影响!明天起,梅州降水又降温→
- ·梅州视觉丨夏日梅州 邂逅鸟趣
- ·梅州市农林科学院果树所倡议:延时采摘金柚,雨过天晴至少一周后采摘为宜!
- ·梅州七部门联合发布通告:注意防范金融领域非法代理维权风险
- ·广东非试点地区首个!梅州实现法人银行环境信息披露工作全覆盖
- ·强冷空气26日起影响我市,有大风以及零星小雨!做好防寒防风使命→
- ·12月起,梅州使用社会保障卡发放城乡居民养老保险待遇
- ·同心共克难 客商显担当!广东省客家商会汇聚企业爱心向丰顺驰援抗疫物资
- ·职工医保门诊报销选择【梅州铁炉桥医院】,线上办理很方便!
- ·多元化科技帮扶茶叶种植,驻银江村落子科技特派员团队助力“百万万工程”
- ·梅龙高铁径纸隧道顺利贯通 系全线施工难度最大的隧道
- ·梅州市农林科学院果树所倡议:延时采摘金柚,雨过天晴至少一周后采摘为宜!
- ·销毁商品货值逾150万元!梅州举行2022年侵权假冒伪劣商品统一集中销毁活动